s
19 708 Pages

ribonucléase III
modèle en trois dimensions de' src=
Une molécule de Dicer (homotétramère cristallisé de Giardia intestinalis) Qui catalyse la coupe d'un ARNdb à siRNA.
numéro CE 3.1.26.3
classe hydrolases
nom systématique
ribonucléase III
autres noms
RNase III; ribonucléase III; joueur aux dés
bases de données BRENDA, ExPASy, GTD, KEGG, APB
source: UIBBM

la ribonucléase III ils sont enzymes de la classe hydrolase, qui catalysent le clivage endonucléolytique d'un 5'-fosfomonoestere.

En particulier, la ribonucléase III connu sous le nom joueur aux dés Il participe à la dégradation de la longue molécules de ARN double brin (ARNdb) et pré-microRNA (MiARN) en filaments de 21 nucléotides (la siRNA) Au cours du processus de L'interférence ARN. Son nom (qui pourrait être traduit en italien noix du générateur), Il découle de sa capacité à réduire les molécules de taille hétérogènes de petits blocs de taille uniforme. Ce nom a été inventé par Emily Bernstein, chercheur à Cold Spring Harbor Laboratory qui a d'abord identifié comme particularité de nell'enzima. Selon des données récentes, Dicer fait partie du complexe RISC.

Mécanisme d'action

ribonucléase III
Détail d'un coupe-monomère. Les domaines de RNase sont en vert, le domaine PAZ jaune, le domaine plate-forme dans le cadre de l'hélice rouge et bleu. On croit que la distance entre les domaines de RNase et PAZ est un déterminant majeur de la longueur de siRNA.

Dicer catalyse la première réaction du procédé de L'interférence ARN, produire les molécules de siRNA (double brin ARN de 21 nucleotides avec une extrémité saillante 3 ») d'interférence réel nécessaire, médiée par RISC dans son ensemble. L'enzyme appartient à la famille de la classe RNase III (les ARNdb spécifiques), et fonctionne de sorte que la coupe ATP-dépendante.

Le groupe Bernstein Dicer identifié par un criblage extensif de gènes Drosophila melanogaster et Caenorhabditis elegans contenant typique des domaines RNase III. Un tel criblage, en fait, conduit à la découverte du gène (Drosophila) CG4792, contenant deux domaines RNase III. Des chercheurs ont donc procédé à des essais supplémentaires sur l'activité exercée par le produit du gène, découvre qu'il est capable de produire des siRNA par une séquence d'ARN double brin.

Ils ont ensuite été identifiés plusieurs autres produits de protéines similaires à Dicer. Tout le monde a au moins cinq domaines spécifiques:

  • une région amino-terminale dépendante de l'ATP;
  • une région plate-forme chargé positivement;
  • PAZ une région, qui est associée à la protéine Argonaute2;
  • deux ou plusieurs domaines RNase III;
  • une région carboxy-terminale capable de lier des molécules d'ARNdb.

À la suite de l'analyse en profondeur de la structure tridimensionnelle de l'enzyme dans Giardia intestinalis, on pense que la distance entre les domaines région PAZ et la RNase III devrait être 65 Angstrom, assez pour loger environ 25 nucléotides. Cet espace serait précisément constitué par région plate-forme qui est chargée positivement, elle est capable d'établir des liaisons électrostatiques avec l'ARN. Selon cette analyse, donc, la structure de Dicer pourrait être celle d'une espèce de règle moléculaire, qui permettrait à l'enzyme pour produire des fragments de taille très régulière siRNA[1].

notes

bibliographie

  • (FR) Crouch, R.J. Ribonucléase 3 ne se dégrade pas des hybrides d'acide ribonucléique acide désoxyribonucléique. J. Biol. Chem. 249 (1974) 1314-1316. PubMed Entrez- 4592261
  • (FR) Rech, J., Cathala, G. et Jeanteur, P. L'isolement et la caractérisation d'une activité de ribonucléase spécifique de l'ARN double brin (RNase D) à partir de cellules de Krebs II ascites. J. Biol. Chem. 255 (1980) 6700-6706. PubMed Entrez- 6248530
  • (FR) Robertson, H.D., Webster, R. E. et Zinder, ouverture numérique Purification et propriétés de la ribonucléase III d'Escherichia coli. J. Biol. Chem. 243 (1968) 82-91. PubMed Entrez- 4865702
  • (FR) Grunberg-Manago, la stabilité de l'ARN messager M. et son rôle dans le contrôle de l'expression des gènes dans les bactéries et les phages. Annu. Rev. Genet. 33 (1999) 193-227. [PMID 10690408]
  • (FR) Court, D. traitement de l'ARN et de la dégradation par la RNase III dans le contrôle de la stabilité de l'ARNm. Dans: Belasco, J.G. et Brawerman, G. (Eds), contrôle de l'ARN messager de stabilité, Academic Press, New York, 1993, p. 71-116.
  • (FR) Zhang et K. Nicholson, A. W. Réglementation de la ribonucléase III par traitement antideterminants de séquence en double hélice. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94 (1997) 13437-13441. PubMed Entrez- 9391043